ค้างคาวหนูเป็นไม้พุ่มไม่ผลัดใบ สูง ๑-๔ ม. เปลือกบางเรียบ สีเทาอมขาว
ใบประกอบแบบขนนกปลายคี่ เรียงเวียน มีใบย่อย ๓-๕ ใบ หรืออาจลดรูปเหลือเพียงใบเดียว เรียงสลับรูปไข่หรือรูปรี กว้าง ๒-๔.๕ ซม. ยาว ๕.๕-๑๐ ซม. ปลายแหลม โคนมนหรือสอบเล็กน้อย ขอบเรียบแผ่นใบหนาคล้ายแผ่นหนัง ผิวเกลี้ยง มีต่อมน้ำมันใส ๆ กลิ่นหอมกระจายทั่วไป เส้นแขนงใบข้างละ ๘-๑๒ เส้น เห็นชัดทางด้านล่าง เส้นใบย่อยแบบร่างแห พอสังเกต
ช่อดอกมักเป็นดอกเดี่ยวหรือมีดอกไม่เกิน ๒ ดอก ออกตามซอกใบและปลายกิ่ง ก้านดอกสั้นมาก ทั้งกลีบเลี้ยง และกลีบดอกมี ๔(-๕) กลีบ กลีบเลี้ยงสีเขียวอ่อน โคนเชื่อมติดกันเป็นหลอดสั้น ปลายแยกเป็นแฉกรูปสามเหลี่ยม เกลี้ยงทั้ง ๒ ด้าน กลีบดอกสีขาวโคนเชื่อมติดกันเป็นรูปกรวยเล็ก ปลายแยกเป็น ๔(-๕) แฉก รูปไข่ ยาวประมาณ ๒ มม. ปลายและขอบกลีบงุ้มเข้าเล็กน้อย เกสรเพศผู้มี ๘(-๑๐) เกสร ติดรอบรังไข่ รังไข่อยู่เหนือวงกลีบ รูปทรงกลม ขนาดเล็ก เกลี้ยง มี ๒ ช่อง แต่ละช่องมีออวุล ๑ เม็ด ก้านยอดเกสรเพศเมีย สั้นมาก ยอดเกสรเพศเมียเรียวแหลมหรือเป็นลุ่มเล็ก
ผลแบบผลมีเนื้อหนึ่งถึงหลายเมล็ด รูปทรงกลม กว้างและยาวประมาณ ๕ มม. มักมี ๑ เมล็ด
ค้างคาวหนูเป็นพรรณไม้ถิ่นเดียวของไทย มีเขตการกระจายพันธุ์ทางภาคกลางและภาคตะวันออกพบขึ้นตามป่าดิบแล้ง ที่สูงจากระดับน้ำทะเล ๒๐๐-๕๐๐ ม.