กระดุมพระอินทร์เป็นกล้วยไม้อิงอาศัย เจริญทางด้านข้าง มักขึ้นแผ่เป็นกลุ่มตามเปลือกไม้ หัวเทียมกลมแป้น สีเขียวหรือเขียวอมน้ำตาล เส้นผ่านศูนย์กลาง ๐.๖-๑ ซม. มี ๑ ปล้อง ผิวเรียบแต่จะย่นในฤดูแล้ง เรียงตัวค่อนข้างชิดกัน ทุกข้อบนเหง้าที่คล้ายเส้นลวด เส้นผ่านศูนย์กลางเหง้า ๑-๒ มม.
ใบออกที่ยอดหัวเทียม มีเพียง ๑ ใบ รูปขอบขนานแกมรี กว้าง ๐.๗-๑ ซม. ยาว ๐.๘-๑.๒ ซม. ปลายมนหรือหยักเว้าตื้น โคนมนหรือเว้าคล้ายปลายใบ แผ่นใบอวบหนา เป็นร่องตามแนวเส้นกลางใบ
ช่อดอกออกจากโคนหัวเทียม มี ๑ ดอก ก้านช่อรวมทั้งก้านดอกยาว ๑-๑.๕ ซม. ดอกสีเหลืองนวล เส้นผ่านศูนย์กลาง ๕-๘ มม. มีสีน้ำตาลอมแดงตามเส้นกลีบ กลีบเลี้ยงทั้ง ๓ กลีบคล้ายกันและใหญ่กว่ากลีบดอก รูปไข่ กว้างและยาวประมาณ ๓ มม. ปลายมน มีติ่งแหลม กลีบดอกด้าน ข้างรูปขอบขนาน ปลายมน กว้างและยาวประมาณ ๒ มม. กลีบปากอยู่ทางด้านล่าง รูปลิ้น ยาว ๒-๓ มม. หูกลีบปากเป็นติ่งสามเหลี่ยมปลายโค้งไปทางด้านหน้า โคนกลีบปากยึดติดกับปลายคางเส้าเกสรแบบบานพับ เส้าเกสรสูงประมาณ ๒ มม. โคนยึดเป็นคาง ฝาปิดกลุ่มเรณูมีรยางค์ ๒ ข้างคล้ายเขี้ยวโค้งไปทางด้านหน้า กลุ่มเรณูรูปรี มี ๔ กลุ่ม เรียงตัวเป็นคู่รังไข่อยู่ใต้วงกลีบ มี ๑ ช่อง มีออวุลจำนวนมาก ยอดเกสรเพศเมียเป็นแอ่งทางด้านหน้าเส้าเกสร
กระดุมพระอินทร์เป็นพรรณไม้ถิ่นเดียวของไทย มีเขตการกระจายพันธุ์ในประเทศไทยทางภาคตะวันออกเฉียงเหนือและภาคตะวันออกเฉียงใต้