โกงกางน้ำจืดเป็นไม้พุ่ม ผลัดใบ สูง ๑-๒ ม. กิ่งก้าน กลมเกลี้ยง ข้อมักโป่งพองเล็กน้อย
ใบเดี่ยว เรียงตรงข้ามสลับตั้งฉาก รูปรีถึงรูปไข่ กว้าง ๓-๖.๕ ซม. ยาว ๖-๑๓.๕ ซม. ปลายเรียวแหลม โคนมนหรือป้าน ขอบเรียบ เส้นแขนงใบข้างละ ๖-๘ เส้น แต่ละคู่ค่อนข้างขนานกัน ใบอ่อนมีขนสีขาวประปรายทั้ง ๒ ด้าน และมีมากตามเส้นกลางใบและเส้นแขนงใบ ใบแก่เกลี้ยง
ช่อดอกแบบช่อแยกแขนง ขนาดเล็ก มี ๑-๒ ดอก ออกที่ปลายกิ่งหรือตามง่ามใบใกล้ปลายกิ่ง ก้านช่อดอกยาว ๑-๒.๕ ซม. ดอกรูปปากเปิด สีขาว ก้านดอกยาว ๓-๕ มม. มีขนสั้น ๆ นุ่มมือ ใบประดับ ๑ ใบ ขนาดเล็ก รูปคล้ายใบ
ผลแบบผลแห้งแตก รูปทรงกระบอก ปลายป่อง ยาวประมาณ ๓ ซม. เส้นผ่านศูนย์กลาง ๕-๖ มม. เมื่อผลแก่และแห้งจะแตกดีดเมล็ดออก แต่ละผลมี ๔ เมล็ด เมล็ดแบนรูปกลมเบี้ยวหรือรูปไข่ กว้าง ๔-๕ มม. ยาว ๖-๗ มม. มีสันตรงกลาง
โกงกางน้ำจืดเป็นพรรณไม้ถิ่นเดียวของไทย พบแถบ จ. เพชรบุรีและกาญจนบุรี ขึ้นตามพื้นที่ดินทรายหรือเขาหินปูนบนพื้นที่ระดับน้ำทะเลจนถึงสูงประมาณ ๗๐ ม. ออกดอกในฤดูแล้งตั้งแต่เดือนมีนาคมเป็นต้นไป เนื่องจากดอกมีขนาดใหญ่สีขาว จึงอาจปลูกเป็นไม้ประดับได้
ชื่อสกุล Marcania นี้ ตั้งให้เป็นเกียรติแก่ Mr. A. Marcan ผู้อำนวยการศาลาแยกธาตุ กระทรวงพาณิชย์และคมนาคม (กรมวิทยาศาสตร์บริการ กระทรวงวิทยาศาสตร์ และเทคโนโลยี ในปัจจุบัน).