กระดังงาสงขลามีลักษณะต้น ใบ และดอกคล้ายกระดังงา [Cananga odorata (Lam.) Hook.f. & Thomson var. odorata] มาก ต่างกันที่กระดังงาสงขลาเป็นไม้พุ่ม สูง ๑-๔ ม. ใบสั้นกว่า ยาว ๖-๑๗ ซม. ก้านใบยาว ๑-๒.๕ ซม.
ดอกออกเดี่ยวบนกิ่งด้านตรงข้ามกับก้านใบ ก้านดอกยาว ๔-๖ ซม. กลีบเลี้ยงรูปไข่ กว้าง ๔-๗ มม. ยาว ๑-๑.๓ ซม. ปลายแหลม กลีบดอก ๑๕-๒๕ กลีบ บิดและเป็นคลื่นมากกว่ากระดังงา กลีบชั้นนอกยาวและใหญ่กว่ากลีบชั้นในตามลำดับ
กระดังงาสงขลาเป็นพืชที่พบในประเทศไทยที่บ้านจะโหนง อ.จะนะ จ. สงขลา กระดังงาต้นนี้อาจกลายมาจากต้นที่เรียกว่า กระดังงาไทย (พระยาวินิจวนันดร, ๒๔๙๘) ปัจจุบันนิยมปลูกเป็นไม้ประดับ ขยายพันธุ์โดยการตอน