ขามเครือเล็กเป็นไม้เถาหรือไม้พุ่มรอเลื้อย ยาวถึง ๕ ม. กิ่งอ่อนและช่อดอกมีขนสั้นนุ่ม
ใบประกอบแบบขนนกปลายคี่ เรียงเวียน ก้านใบยาว ๐.๕-๑ ซม. หูใบเล็กมากและหลุดร่วงง่าย แกนกลางยาว ๔-๑๒ ซม. มีใบย่อย ๒๑-๓๕ ใบ เรียงสลับกันบนแกนกลาง แผ่นใบย่อยรูปขอบขนาน ยกเว้นใบปลายสุด รูปขอบขนานแกมรูปไข่กลับ กว้าง ๐.๕-๐.๘ ซม. ยาว ๑-๒ ซม. โคนสอบ เบี้ยว ปลายเว้า ก้านใบย่อยสั้นมาก
ช่อดอกแบบช่อกระจะ ออกตามง่ามใบ ดอกรูปดอกถั่ว เล็ก สีขาวถึงสีเหลืองอ่อน ก้านดอกยาวประมาณ ๒ มม. ใบประดับย่อยรูปรี กว้างประมาณ ๐.๕ มม. ยาวประมาณ ๑ มม. กลีบเลี้ยงโคนเชื่อมติดกันเป็นรูปถ้วย ปลายแยกเป็นแฉกแหลม ๕ แฉก ขนาดใกล้เคียงกัน ยาวประมาณ ๔ มม. กลีบดอกกลีบกลางรูปไตแกมรูปโล่ ปลายหยักเว้า ยาวประมาณ ๑ มม. กลีบคู่ข้างรูปขอบขนาน ยาวประมาณ ๒ มม. กลีบคู่ล่างรูปขอบขนานแกมรูปไข่กลับ ยาวประมาณ ๒ มม. เกสรเพศผู้ ๙ อัน ก้านชูอับเรณูเชื่อมติดกันเป็นแผ่นหุ้มรังไข่ รังไข่อยู่เหนือวงกลีบ รูปขอบขนานแกมรูปไข่ มี ๑ ช่อง และมีออวุล ๒ เม็ด
ผลแบบผลแห้งแตกสองแนว รูปขอบขนานแกมรูปแถบ กว้างประมาณ ๑.๓ ซม. ยาว ๕-๖ ซม. บริเวณที่มีเมล็ดจะหนาและแข็งกว่าส่วนอื่น มีเมล็ด ๑-๒ เมล็ด รูปไต สีน้ำตาลแดง กว้างประมาณ ๑.๖ ซม. ยาวประมาณ ๒ มม.
ขามเครือเล็กมีเขตการกระจายพันธุ์ในประเทศไทยทางภาคตะวันตกเฉียงใต้ และภาคใต้ ตามชายป่าดิบ ที่สูงจากระดับน้ำทะเล ๕๐-๑๐๐ ม. ออกดอกระหว่างเดือนมกราคม-มิถุนายน ผลแก่ระหว่างเดือนกรกฎาคม-พฤศจิกายน ในต่างประเทศพบที่อินเดีย พม่า ลาว เวียดนาม ไปจนถึงอินโดนีเซีย และฟิลิปปินส์.